Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms