Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME2

Chst11, Carbohydrate sulfotransferase 11, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst11Q9JME2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst11Q9JME2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms