Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms