Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms