Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SrfQ9JM73 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms