Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms