Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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