Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms