Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Tmod4Q9JLH8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Tmod4Q9JLH8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Tmod4Q9JLH8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Tmod4Q9JLH8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod4Q9JLH8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Tmod4Q9JLH8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod4Q9JLH8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Tmod4Q9JLH8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod4Q9JLH8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Tmod4Q9JLH8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod4Q9JLH8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod4Q9JLH8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod4Q9JLH8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod4Q9JLH8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod4Q9JLH8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod4Q9JLH8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod4Q9JLH8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod4Q9JLH8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod4Q9JLH8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod4Q9JLH8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Tmod4Q9JLH8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod4Q9JLH8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod4Q9JLH8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod4Q9JLH8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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