Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gde1Q9JL56 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms