Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc5a3Q9JKZ2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms