Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms