Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ldb3Q9JKS4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms