Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms