Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ybx3Q9JKB3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms