Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms