Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms