Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Bco1Q9JJS6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Bco1Q9JJS6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Bco1Q9JJS6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Bco1Q9JJS6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Bco1Q9JJS6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Bco1Q9JJS6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Bco1Q9JJS6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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