Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms