Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms