Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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