Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms