Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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