Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN4

C1ql3, Complement C1q-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1ql3Q9ESN4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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C1ql3Q9ESN4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1ql3Q9ESN4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms