Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES81

Popdc3, Popeye domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Popdc3Q9ES81 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Popdc3Q9ES81 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms