Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms