Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb3Q9ERD7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb3Q9ERD7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms