Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms