Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms