Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms