Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms