Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms