Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms