Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riok3Q9DBU3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riok3Q9DBU3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riok3Q9DBU3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riok3Q9DBU3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riok3Q9DBU3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riok3Q9DBU3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riok3Q9DBU3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riok3Q9DBU3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riok3Q9DBU3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riok3Q9DBU3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riok3Q9DBU3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riok3Q9DBU3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riok3Q9DBU3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riok3Q9DBU3 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riok3Q9DBU3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms