Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swt1Q9DBQ9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms