Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms