Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fundc1Q9DB70 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms