Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB07

Ift46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift46Q9DB07 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ift46Q9DB07 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ift46Q9DB07 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ift46Q9DB07 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ift46Q9DB07 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ift46Q9DB07 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ift46Q9DB07 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ift46Q9DB07 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ift46Q9DB07 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ift46Q9DB07 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ift46Q9DB07 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ift46Q9DB07 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ift46Q9DB07 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ift46Q9DB07 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ift46Q9DB07 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift46Q9DB07 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift46Q9DB07 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift46Q9DB07 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift46Q9DB07 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift46Q9DB07 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift46Q9DB07 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift46Q9DB07 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift46Q9DB07 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift46Q9DB07 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ift46Q9DB07 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms