Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAG9

Phf7, PHD finger protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf7Q9DAG9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf7Q9DAG9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf7Q9DAG9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms