Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA5

1700016D06Rik, RIKEN cDNA 1700016D06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016D06RikQ9DAA5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700016D06RikQ9DAA5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700016D06RikQ9DAA5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700016D06RikQ9DAA5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700016D06RikQ9DAA5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700016D06RikQ9DAA5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms