Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms