Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift43Q9DA69 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms