Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smco2Q9DA21 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms