Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms