Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms