Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tvp23bQ9D8T4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms