Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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