Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms