Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms