Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpap3Q9D706 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpap3Q9D706 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms